Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms