Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLEQ07864 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms