Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC6Q03468 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms