Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms