Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms