Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XPCQ01831 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XPCQ01831 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XPCQ01831 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms