Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F1Q01094 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms