Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms