Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FAM3AP98173 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FAM3AP98173 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FAM3AP98173 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FAM3AP98173 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FAM3AP98173 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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