Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VLDLRP98155 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms