Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMF1P82094 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms