Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms