Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms