Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms