Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPS3AP61247 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPS3AP61247 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms