Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SESN3P58005 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SESN3P58005 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms