Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRP55822 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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