Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEC13P55735 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEC13P55735 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC13P55735 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms