Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP9P55211 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms