Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PXNP49023 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PXNP49023 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PXNP49023 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PXNP49023 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms