Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPD2P43304 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPD2P43304 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPD2P43304 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPD2P43304 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms