Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGER3P43115 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms