Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms