Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MDH1P40925 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MDH1P40925 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms