Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAEP38570 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms