Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms