Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SPRR1AP35321 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SPRR1AP35321 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms