Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA9P31269 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms