Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP1P29466 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms