Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR1EP28566 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HTR1EP28566 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms