Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFP26441 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CNTFP26441 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms