Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LMO2P25791 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO2P25791 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms