Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPREP23469 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPREP23469 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPREP23469 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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