Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
XPAP23025 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
XPAP23025 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
XPAP23025 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms