Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms