Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTPS1P17812 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms