Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms