Protein–RNA interactions for Protein: P12643

BMP2, Bone morphogenetic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP2P12643 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BMP2P12643 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms