Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD63P08962 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD63P08962 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD63P08962 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD63P08962 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms