Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPBP07199 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPBP07199 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms