Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERPIND1P05546 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms