Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CBX7O95931 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms