Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX3O95343 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX3O95343 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX3O95343 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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