Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEBLO76041 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEBLO76041 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms