Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SIN3BO75182 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIN3BO75182 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms