Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms