Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms