Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRICKLE3O43900 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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