Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DENRO43583 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DENRO43583 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DENRO43583 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms