Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNFSF14O43557 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms